Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms