Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA9Q9BWV2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms