Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TINF2Q9BSI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TINF2Q9BSI4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms