Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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