Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MESP1Q9BRJ9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms