Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms