Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms