Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms