Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ZCCHC13Q8WW36 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms