Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms