Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms