Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms