Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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