Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNT1Q5JUK3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNT1Q5JUK3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms