Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms