Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms