Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms