Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PPP1R3AQ16821 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PPP1R3AQ16821 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms