Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNHIT3Q15649 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms