Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms