Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
EEA1Q15075 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EEA1Q15075 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EEA1Q15075 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
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