Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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