Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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