Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IHHQ14623 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IHHQ14623 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IHHQ14623 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IHHQ14623 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IHHQ14623 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IHHQ14623 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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