Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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