Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PKP1Q13835 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PKP1Q13835 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PKP1Q13835 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PKP1Q13835 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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