Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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