Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms