Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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