Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD300CQ08708 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms