Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms