Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms