Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms