Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms