Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms