Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms