Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms