Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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