Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms