Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms