Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAP1GDS1P52306 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms