Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF144AP50876 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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