Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNTAP49354 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms