Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms