Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms