Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms