Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms