Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC12P31275 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms