Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCAP28676 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCAP28676 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCAP28676 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCAP28676 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms