Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms